海军军医大学第一附属医院神经外科，建科于1953年，是上海最早设立神经外科的医院之一。1953年在裘法祖和郑宝琦教授的指导下，由杨次文和叶耀山、赵孟尧医师成立神经外科专业组。1958年正式成立神经外科，属外科领导，由李家桂任科室领导，医师有叶耀山、赵孟尧和过宗南。1969年医院调防西安，接收第四军医大学第一附属医院（西京医院）神经外科病区。1975年医院回迁上海，1979年执行新编制，李家桂为科主任，赵孟尧为副主任。赵孟尧于1980~1991年、王文仲于1992~1997年、周晓平于1997~2006年、刘建民于2006~2020年担任科室主任。2020年12月起，陈菊祥教授担任神经外科主任。

经过六十多年发展，长海医院神经外科已建设成为国家重点学科、国家临床重点专科、国家神经外科专科医师培训基地、国家脑胶质瘤多学科诊治联盟中心、国家脑卒中筛查与防治示范基地、国家高级卒中中心、全军脑血管病研究所、上海市脑卒中临床救治中心、帕金森病专病诊治中心。神经外科首批硕士点、博士点、博士后工作站。

科室以颅脑战创伤、神经肿瘤（脑胶质瘤、颅底肿瘤、神经脊柱肿瘤等）及功能神经外科诊治为专业特色。治疗范围包括颅脑战创伤、脑胶质瘤、脑膜瘤、垂体瘤、听神经瘤、脊柱脊髓肿瘤、帕金森病、特发性震颤等等。科室年门、急诊量约15000余人次，年神经外科开颅手术量1200余台。

科室拥有全球最先进的蔡司显微镜及智能手术系统、睿米手术机器人、高清4KSTORZ内镜，电磁刀，超声外科吸引系统(CUSA)，神经导航、术中神经电生理监测等先进医疗设备。

学科带头人：陈菊祥，教授、主任医师、博士生导师。国家百千万人才工程、国务院有突出贡献中青年专家荣誉称号；军队高层次创新人才工程-拔尖人才、上海领军人才；上海市优秀学科带头人等。中国医师协会脑胶质瘤专委会常委、中国医师协会颅底外科专委会委员；中国抗癌协会脑胶质瘤专委会常委、上海市抗癌协会神经肿瘤专委会副主任委员；上海市神经外科专科分会委员；全军神经外科专委会委员；中国胶质瘤协作组委员。

科室共承担国家、军队及上海市课题125项，基金总额4458万元。其中主持国家863高科技计划1项，国家自然科学基金43项；其他国家级课题10项；军队级课题7项；上海市课题68项；

科室现有医疗护理人员50余人，主任医师、正教授3人，副主任医师、副教授8人，主治医师10人，住院医师2人。获国家、军队、上海市一等奖6项、二等奖10项、三等奖7项。开展床位41张。