上海市东方医院内分泌科是浦东新区重点专科，2010年正式成为卫生部批准的内分泌科医师培训基地、是上海市住院医师规范化培训基地，是上海市护理学会社区糖尿病护士培训基地。

内分泌科开展各种内分泌疾病的诊治，包括糖尿病及其急慢性并发症、甲状腺疾病、肾上腺或垂体疾病、骨质疏松症、肥胖症等疾病。同时开设新代谢病管理模式——标准化代谢性疾病管理中心（MetabolicManagementCenter，简称MMC），糖尿病护理门诊，以糖尿病的个体化治疗、优质护理为学科特色。已成立“东糖俱乐部”，定期开展糖尿病防治知识讲座和患者交流活动。科室连续10年获东方医院“文明示范集体”称号。