北京市平谷区中医医院针灸科为北京市级重点专科，平谷区卫生局“51020”工程优势学科，国家中医药管理局十二五康复重点专科培育项目，建有北京中医药薪火传承“3+3”工程周德安名医传承工作站平谷分站、平谷区中医临床人才工作室、平谷区重点学科王麟鹏专家工作室。为首都区域“1+X+N”重点专科及北京中医医院大科联合建设科室。科室现有医护人员29名，硕士研究生7名。科室日均门诊量200余人次，病区现有床位39张。

科室独立承担和参与市局级等科研20余项。科室优势病种和专病专台：针灸、中西药物及康复综合治疗脑血管病；中西医结合治疗失眠、焦虑抑郁状态、头面痛；针药结合治疗面瘫、耳鸣、耳聋、鼻炎；经络调衡调理亚健康状态人群、代谢综合征；针药及理疗治疗颈肩腰腿痛；三伏贴、三九贴治疗呼吸系统疾病及颈肩腰腿痛、脾胃虚寒。