首都医科大学附属北京康复医院消化内科(消化科)隶属于胃肠康复中心。包括门诊、病房、内镜中心三部分。现有消化内科医生5人，其中主任医师2人、主治医师2人、住院医师1人。
门诊：在门诊楼二层，包括专家门诊及专科门诊。主要诊治消化专业常见病、多发病，如食管炎、急慢性胃炎、胃溃疡及十二指肠球溃疡、幽门螺杆菌感染、胆囊炎、胰腺炎、各种原因的肝炎、肝硬化及其并发症、急慢性结肠炎、功能性胃肠病、炎症性肠病、缺血性肠病；各种肿瘤的门诊随访等。
病房：在综合楼一层，消化内科收治三类患者。
其一，各种原因所致的消化系统脏器功能障碍，需要行康复治疗的患者，如吞咽障碍、胃食管反流、功能性消化不良、消化性溃疡、肝功能异常、胰腺功能异常、神经源性结肠等；
其二，消化系统常见病、多发病及消化系统疑难急重症需住院治疗的病人，如急慢性上消化道出血、各种原因所致的急慢性肝炎（除甲戊肝）、肝硬化及各种并发症、急慢性胆囊炎、急慢性胰腺炎等；急慢性结肠炎症、炎症性肠病、各种需要内镜下治疗的疾病患者；
其三，各种肿瘤的放化疗、康复治疗、中医药治疗、营养支持等综合治疗。
内镜室：在门诊楼三层，拥有国内最先进的内镜设备，洗消设备、储镜设备，功能性疾病诊治设备。能开展普通胃肠镜、无痛胃肠镜、急诊胃肠镜、鼻胃镜、染色内镜等的操作，能进行胃肠镜下多项治疗。
消化内科凭借医院发展壮大的契机，依托医院领导的支持，依靠胃肠中心内外科的密切合作，依靠科室医护人员的不懈努力，力争为广大患者提供更便捷、优质的服务。