北京协和医院康复医学科是独立科室，1921年，北京协和医院成立，同年，时任神经科主任的美国人AndrewHWoods教授创立了理疗室，开展对神经疾病患者的电刺激疗法。1932年，美国的理疗学家MaryMcMillan女士来到北京协和医院，创立了独立的理疗科，标志着北京协和医院理疗科的正式成立，是今天康复医学科的前身。
1948年美籍华人黄厚璞女士接任理疗科主任，在原有工作基础上，又开展了按摩疗法。1953年，杨子彬大夫由苏联专家举办的理疗培训班结业后来到北京协和医院，1954年，邹贤华教授获得前苏联理疗学博士学位后来到协和医院，他们曾分别前后担任理疗科副主任、主任。
二十世纪80年代以来，中国的康复医学事业飞速发展，北京协和医院理疗科抓住机遇，充实了现代康复医学的内容。1986—2005年华桂茹大夫先后担任科室副主任、主任。2007年，陈丽霞大夫担任科室副主任，第一负责人，王燕大夫同时任科室副主任。2014年陈丽霞大夫担任科室主任，刘颖大夫担任科室副主任；刘淑芳任主任助理、李清任治疗师组长，袁望舒任门诊组长。
二十世纪90年代科室最早引入澳大利亚手法治疗技术，并举办多期全国培训班进行推广。2003年在国内率先开展血友病骨关节并发症的康复评定与康复治疗，居全国领先水平，目前是中国血友病诊疗中心协作网物理治疗组组长单位，是世界血友病联盟(WFH)在中国大陆地区唯一授权的血友病物理治疗培训基地，每年牵头举办全国血友病物理治疗研讨会和培训班，牵头完成血友病骨关节并发症康复中国专家共识。
近年科室的发展得到医院的大力支持，诊疗环境得到大力改善。目前科室亚专业发展全面，包括肌骨康复，神经康复、心脏康复、肺康复、血友病及罕见病康复、青少年脊柱侧弯康复，重症康复、女性盆底康复、老年康复、淋巴水肿保守治疗等。科室持续注重学科建设及人才培养，设立有物理治疗区、康复评定区、体疗和作业治疗区、水疗区、按摩手法治疗区，言语和认知治疗区。
目前，科室有康复医师7名；康复治疗师19名。专业设置日趋完善，人员结构更加合理。学科建设的核心是人才培养，近年科室先后有3名员工获选医院“百人计划”人才培养项目，先后赴美国加州大学旧金山分校、美国约翰霍普金斯老年医学中心、纽约西奈山医学院、纽约大学皇后医院、芝加哥大学医学院进修学习，将世界先进的康复管理理念、康复评定与治疗新技术带回国内。同时，与WFH、国际预防治疗研究组（IPSG）、加拿大多伦多儿童医院、加拿大卡尔加里大学、UCSF、JHP等保持着良好的交流合作。随着社会的进步，经济的发展，人们对生活质量有了更高的追求；同时，由于疾病模式的转变，医疗服务的理念也会随之发生巨大变化，将走出单一的治疗模式，向着预防、治疗、康复、保健多领域伸展，人文化、立体化、全方位是医疗服务发展的必然趋势。康复医学科作为一门以功能恢复为终极目标、蕴涵深刻人文关怀的学科，无疑将进入其发展的黄金时代。“风物长宜放眼量”，物理医学康复科立足当下，放眼未来，全科上下，团结奋进，伴随着协和的发展，终将成为协和群星中熠熠发光的一颗。