肛周脓肿都是起源于肛隐窝的细菌感染，扩散到肛门周围各层肌肉的间隙行成脓肿，由于肛门内持续高压状态，发生脓肿后肛隐窝的破口很难自己长上，急性脓肿好了以后经常会有少量含细菌的脏东西从这个破口进入感染，行成的肌肉间隙，成为肛瘘，平时没有明显不适，大约半年会有一次急性脓肿的发作，所以肛周脓肿如果是首次发作，有少数病人可能自行愈合，大多数和多次发作的病人都是有肛瘘，不能自行愈合，需要手术治疗了。