中国人民解放军总医院第一附属医院眼科正式成立于2007年8月，该科为该中心综合组、全军眼外伤专业组成员单位，现有工作人员22人，包括在职人员18人、外聘专家4人，医生中高级职称7人，主治医师4人，住院医师2人，均具有硕士以上学历；护士中主管护师1人，护师1人，护士7人，技术员1人。

目前拥有700万元进口诊疗设备，可进行动态视野、眼电生理、角膜地形图、眼底荧光血管造影等检查，手术治疗眼整形美容、近视眼LASIK手术矫正、眼眶肿瘤、白内障、青光眼、视网膜脱离等各种眼科疾病及眼底激光治疗，尤其是眼外伤（视神经间接损伤）、组织工程角膜上皮移植治疗眼表疾病及眼科病理学更具特色，对严重化学烧伤及眼表疾病的治疗在军内及北京地区有一定影响。

科室目前已获全军科技成果二等奖1项，医院医疗成果奖4项。该科设有眼科独立的手术室，准分子激光治疗近视等屈光不正在门诊预约手术，白内障超声乳化、人工晶状体植入术和玻璃体视网膜手术等均由专家完成。