鄂尔多斯市中心医院消化科成立于2009年，由消化科病房、消化内镜中心及消化专科门诊组成。病房设有病床38张，有医护人员26名，包括主任医师3名、副主任医师3名、主治医师6名、住院医师2名；其中，拥有硕士学位者6名。消化病房针对肝病、炎症性肠病、消化胆胰疾病、胃肠动力疾病等设立了三级学科，实现了专病专治、专病精治。医疗团队陆续派遣医师前往北医三院、北京友谊医院及武汉协和医院进行专业进修，包括胃、十二镜指肠诊治4人、肝病诊治1人、胃肠道动力学1人、超声内镜1人。同时，也有医师赴上海长海医院接受ERCP专业培训，并取得了中国医师协会内镜医师培训学院颁发的ERCP学习班培证书。科室在消化系统常见病、多发病的临床诊治基础上，对疑难肝病、急性重症胰腺炎、重症炎症性肠病、难治性幽门螺旋杆菌等疾病进行更为深入的研究。在内镜诊治方面开展了无痛胃肠镜检查技术、内镜下止血术、消化道早癌切除术、胃、大肠息肉及其它良性肿瘤内镜下切除术、消化道肿瘤支架植入术、内镜下胆总管、胰管结石取石治疗，胆总管、胰管良恶性肿瘤支架植入术、内镜下食管静脉曲张套扎术、肝脏穿刺活检术等国内先进的消化内镜治疗技术。科室亦极其重视科研工作，承担了1项内蒙古自然科学基金项目和1项鄂尔多斯市科技重大专项储备项目，发表了50余篇论文，其中包含3篇核心期刊论文，并编著了4部专业书籍。