包头医学院第二附属医院消化微创中心作为区域性微创外科中心，共设床位100张。

拥有6个专业治疗组（肝胆胰肿瘤专业组、胃肿瘤专业组、结直肠肿瘤专业组、胆石症专业组、食管裂孔疝专业组、疝和腹壁外科专业组），承担着包头及周边盟市的疑难消化系统疾病的外科诊疗。同时承担着20余位国内知名专家包头工作站的医疗、教学、科研工作。