新疆军区总医院北京路临床部心胸外科是以心胸、普胸为主要业务范围的综合科室，自建科以来，特别95年科室与北京阜外心血管医院建立协作关系以来，已开展各类心脏手术2000余例。科室在阜外医院的帮助指导下，在新疆地区已形成规模，收治了众多心脏患者，解决了广大边疆各族患者到内地路途远、就医难、消费高等困难。

心胸外科共完成冠状动脉搭桥术200余例，各类心脏瓣膜置换术400余例，各类先心病900余例，其它各类心脏手术600余例，所开展的手术中有些已达到了国际国内先进水平。重症监护病房设施齐全，现有全套八台床旁德国产Hading监护系统，四台德国产西门子900C呼吸机及微量泵等配套设备。科室还有一支能吃苦、能战斗，工作认真、服务态度好、业务技术精湛的重症监护护理队伍，使各类手术后的监护得到有力的质量保证。