新疆医科大学第五附属医院神经外科组建于1988年。1992年4月成立独立科室，历经20余年发展，经历了三任科室主任辛勤付出，目前设有床位30张。主要开展颅脑外伤、肿瘤、颅内动脉瘤夹闭术、脑血管病介入治疗、高血压脑出血微创、立体定向治疗、经鼻蝶垂体瘤手术以及椎管内肿瘤等。

目前科室有两个亚专业组，常剑副主任医师负责脑出血及脑血管病组，主要负责脑出血的治疗，以及脑血管病、脊髓血管病的筛查及血管内治疗。黄荣副主任负责颅脑外伤及肿瘤组，主要负责各种类型的颅脑外伤、颅内及椎管内肿瘤。

现有高级职称3人，主任医师1名，硕士生导师1名，副主任医师2名。中级职称4名，其中硕士2名，博士1名。医生6名，护理人员10名。科室主任刘鹏，主任医师、副教授、硕士生导师，担任新疆神经外科专业委员会常委。科室在医疗、教学等方面逐步发展，圆满完成医疗教学任务。

2008年-2012年每年都有院内新技术获奖，2012年院内资助课题1项。2013年校级科创基金1项。2018年获自治区自然科学基金一项。完成硕士生培养7名。科室发表各类文章数十篇，其中核心期刊十余篇，SCI一篇。科室连续多年获院先进集体荣誉称号。

在院党委领导下能够在医院的发展和其它工作中与院党委保持一致。在医疗活动中科室能够严守医德医风，全科同志思想认识逐步适应医院发展要求，全体同仁注重医疗质量，合力促发展。科室的服务质量明显提高，社会效益和经济效益继续提升。

科室人员在工作中始终把医疗安全作为医疗活动的生命线，多年来未发生任何医疗事故和严重医疗纠纷；他们的职业道德和敬业精神在为患者的服务中得到了体现。在科室形成团结、和谐的人际关系。科室人员年龄层次合理，学历较高，发展潜力大。在诊治颅脑外伤、老年脑血管病方面有较好声誉。