新疆医科大学第二附属医院眼科是集医疗、教学、科研为一体的临床科室。

现有在职医生5名，技术人员2名，其中副主任医师1人，主治医师2人，住院医师2人，其中4人具有硕士研究生学位。

科室现有床位17张，配有OCT、眼底造影机、自动视野计、532激光、手术显微镜、玻切超乳一体机等检查及治疗设备。

开展了白内障、青光眼、玻璃体及视网膜疾病、斜视、眼外伤等多种眼部手术。