新疆医科大学第一附属医院普通外科是新疆维吾尔自治区重点学科博士学位授予单位及博士后流动站，2010年以普通外科为主体的医院外科学获得了国家级精品课程。并于2012年获国家级临床重点专科；作为临床基地支撑国家重点实验室培育基地，国家全科医师和自治区级住院医师培训基地；2002年肝肾移植为主要临床技术和研究的自治区级器官移植研究所，成为新疆实力最强的从事器官移植的临床基地。

根据临床专科成熟度，2005年普通外科细分为7个亚专业临床病区，即：肝胆包虫外科，肝脏腹腔镜外科，胰腺外科，胃肠外科，血管甲状腺外科，乳腺外科，肛肠外科，共有床位249张，医护人员165人。近三年来获国家科技进步奖二等奖1项，中华医学会科技奖医学科普奖1项，自治区级科技进步二等奖5项，三等奖1项，新疆医学科学普及奖优秀奖1项，在各级期刊发表论著100余篇，其中SCI论文24篇。

普通外科注重与国内外的专业学术交流，每年邀请国内外知名院士、专家学者传授先进外科理念，提升学科技术和学术水平。近三年共举办大型国际学术会议3次，即：第六届HPB中法奥、首届中亚人畜共患病防治研讨会，尤其是第24届国际包虫病大会。

国家级学术会议10次，自治区级学术会议3次，有效支撑了“喀纳斯科学与艺术论坛”，做为新疆外科学会、普外科分会和器官移植学会主任委员单位，每年租住学会委员常委和专业学组地州行和参加中国外科学会和外科医师协会年会，彰显新疆普外科特色和水平，推动我国西部地区普通外科事业的发展做出应有的积极贡献。