中国人民解放军第五十九医院神经外科1994年医院购买CT后神经外科取得较快发展，先后开展大小脑半球肿瘤、鞍区及桥小脑角区肿瘤、脑室肿瘤切除；2000年开展显微神经外科手术。2002年开展立体定向手术（颅内异物取出、脑内病变活检、脑深部肿瘤切除术、脑深部神经核团毁损术治疗帕金森氏病），锁孔手术经颅内神经根减压术治疗三叉神经痛、舌咽神经痛及面积痉挛，癫痫外科手术治疗。

2006年神经外科正式分科独立后发展更加迅速，锁孔手术治疗三叉神经痛、舌咽神经痛及面积痉挛病例数已超过150例，患者来自全省各地，部分来自省外。应用神经导航使神经外科手术进入微侵袭时代，在神经导航引导下开展颅内各部位肿瘤切除术、各种颅内血肿清除术、颅内异物取出术、病变活检术，并把神经导航应用在高血压脑出血手术中，取得非常好效果。在神经导航引导下开展经鼻蝶垂体瘤切除术，使经鼻蝶垂体瘤切除手术更加安全。

到目前为止神经导航手术已超过100例，在省内处于领先。形成颅脑外伤规范化治疗，及时手术，尽早应用呼吸机支持，亚低温冬眠治疗等，使重型颅脑外伤抢救成功率提高，致残率降低。现有多排螺旋CT、MRI、DSA、史赛克神经导航仪（云南省仅有两台）、莱卡显微镜、立体定向仪、动态脑电图仪、呼吸机、亚低温治疗仪、监护仪及蛇牌显微器械。