昆明市妇幼保健院中医科擅长中医辩证诊治妇科、儿科、内科等疾病，如月经不调、不孕症、围绝经期综合症、孕前产后调理、小儿厌食、疳积、感冒、咳嗽、胃痛等。以妇、产、儿多发常见病、小儿内科疾病及保健推拿、异位妊娠保守治疗专病及多科室查房、会诊为特色。妇科中医组以中医慢性盆腔痛中药外治疗法为特色，儿科中医组在丹霞院区以小儿脑瘫康复治疗及小儿推拿为特色。

开展针灸、艾灸、拔罐、穴位贴敷、颈腰椎、骨关节疾病的手法复位、耳穴压豆、热奄包及中药离子导入、微波、中药足浴、小儿疾病推拿、电针治疗、中频治疗、微波治疗、牵引治疗、中药定向导入、中医体质辨识膳食、治未病、膏方、三九三伏贴、癌症化疗止呕贴等中医特色治疗。积极响应中医药法及国家大力发展中医药要求，中药房提供中药饮片及代煎，同城异地配送，中药智能免煎剂等服务。