深圳市第三人民医院（南方科技大学第二附属医院）始建于1985年，是由深圳市政府举办的一所“强专科、大综合”的现代化三级甲等研究型医院。医院占地面积21.3万平方米，建筑面积44万平方米（改扩建二期及国研中心建设完成后将达64.3万平方米），编制床位1955张。现有员工2100余人，其中，长江学者1人，国家百千万人才工程2人，国务院特殊津贴专家3人。医院先后自主培养了深圳市卫生系统2位国家自然科学基金杰出青年基金学者、首位国家自然科学基金优秀青年基金学者。目前，已建设成为粤港澳大湾区规模大、设备先进、功能完善的感染性疾病诊疗与研究中心，主要承担着深圳市及周边地区传染病与重大疫情的防控任务并开展综合医疗服务。

医院于2017年首获肝、肾器官移植资质，是深圳市最早取得器官移植资质的医院；2018年，顺利通过三级甲等医院评审，获批成为广东省高水平医院建设单位；成为南方科技大学第二附属医院；2019年，获批成为国家感染性疾病临床医学研究中心（深圳市唯一一家、广东省第三家）；2020年，建成深圳市第三人民医院应急院区，荣获广东省抗击新冠肺炎疫情先进集体、广东省先进集体、广东省先进基层党组织、深圳市抗击新冠肺炎疫情先进集体、深圳市先进集体、深圳市先进基层党组织；获批成为国家级住院医师规范化培训基地；成为中国医学科学院深圳传染性疾病诊疗研究中心；在《2020年度中国医院排行榜》中，医院首次进入全国百强医院榜单，是深圳市首家进入复旦版中国百强医院排行榜的医院；结核病学科进入复旦版《中国医院专科综合排行榜》第4名。2021年，在中国医院科技量值医院五年综合ASTEM排名榜中位列全国第80位（广东省第10位、深圳市唯一百强）；综合STEM排行榜中位列全国第76（广东省第10位，深圳市第1位）；医院结核病学科全国排名第5，传染病学科全国排名第7，广东省排名双第1位；呼吸病学排名第24位，消化病学排名第46位，护理学排名第60位。2022年，获批深圳市发展和改革委员会“生物治疗重大公共服务平台”，顺利通过三级甲等医院复审、国家电子病历系统功能应用水平六级评审，是目前国内少有同时通过电子病历应用水平六级和互联互通五乙评审的医院。荣获全国科技系统抗击新冠肺炎疫情先进集体、全国消除疟疾工作先进集体；入选广东省公立医院改革与高质量发展示范医院。在复旦大学医院管理研究所发布的《2022年度中国医院排行榜》中,排行第100位，再次跻身百强医院。2023年，荣获广东省医疗系统先进集体；新增肺、胰腺器官移植资质，是目前全市乃至全省器官移植资质最全的医院之一。在中国医学科学院公布的“2023年度中国医院科技量值”排名中，我院结核病学位列全国第4（较上一年上升1名），传染病学位居全国第11（较上一年上升1名），广东省排名双第1位。呼吸病学排名第33位，消化病学排名第40位（较上一年上升6名），皮肤病学排名第30位（较上一年上升22名），烧伤外科学排名第99位。2019-2023年五年科技量值（ASTEM）排名中，结核病学我院位列第7，传染病学位居全国第13位，消化病学排名第38位，呼吸病学排名第30位，皮肤病学排名第52位，烧伤外科学排名第91位。2024年，新增眼角膜移植资质；基本科学指标数据库（ESI）临床医学领域、免疫学排名晋升全球前1%；医院5位专家学者入选全球前2%顶尖科学家榜单，自2019年榜单发布以来，我院共计26人次入选。

医院设有医疗医技科室56个，初步完成“强专科、强综合”的战略布局，逐步形成了感染医学、器官移植和生物治疗“三驾马车”引领医院高质量发展的新格局。建设有感染性疾病国家临床重点专科、广东省高水平临床重点专科（感染性疾病科、结核病科及器官移植科），依托国家感染性疾病临床医学研究中心和感染病国家重点专科、香港大学新发传染病国家重点实验室深圳分室，已形成新突发传染病、结核病、艾滋病、肝病等亚专科和四大药物临床试验基地齐全的学科体系，基本形成了综合学科“反哺”传染病学科的局面，逐步由三级甲等专科医院向三级甲等综合医院转型发展。

医院创新组建“4+4+1”科研体系，建设有深圳市肝病研究所、医工交叉研究院、移植研究中心、微生物免疫（新发传染病）研究中心等四大临床基础融合创新平台，拥有BSL-3实验室（含SPF级动物室）、生物样本库、开放共享实验室、生物治疗中心等四大研究类公共服务平台，搭建临床研究中心（医学大数据平台），科研设备总价值超过2亿元。医院拥有深圳市首个顶级复合手术室，配备第四代达芬奇机器人；拥有我国第一家智能化整合实验室；配备最先进的256排CT、3.0 T高场强核磁共振、大平板数字减影血管造影机（DSA）及C臂血管机、乳腺机、数字化双板X线摄影系统和数字化胃肠机等一系列现代化影像检查设备。

医院坚持以科技创新为引领、临床需求为导向，积极承担及参与重大传染性疾病相关课题项目，开展病毒学、诊断试剂研发、致病机制、临床特征、药物及血浆治疗等研究，取得了系列硬核成果：获批我国首个自主知识产权新冠病毒中和抗体联合治疗药物，成功助力利托那韦片等新冠病毒治疗药物，推动首台国产ECMO上市。2018年至今，医院牵头发布专家共识18部，主持科技部重大专项等国家级课题101项，包括国家自然科学基金重大研究计划1项、国家自然科学基金探索计划项目1项、国家重点研发计划项目级3项、国家自然科学基金杰出青年基金1项、国家自然科学基金优秀青年基金1项、国家科技创新2030重大项目课题级1项；以第一或通讯作者在国际顶级期刊发表SCI论文649篇，总影响因子超5419分，其中，IF＞10的论文共计142篇，IF＞30的论文共计32篇。

未来，深圳市第三人民医院将以“国际一流、世界领先”为目标，按照医疗水平国际化、环境设施现代化、医疗服务精细化、诊疗流程规范化、运营管理智慧化的标准，构建集医疗、教学、科研、预防以及预警预测为一体的国家感染性疾病临床医学研究中心和国家综合性区域医疗中心，形成“学科－人才－项目－平台－成果－产品”的一体化的创新发展模式。