深圳市第三人民医院妇产科分为妇科和产科。
（一）妇科
深圳市第三人民医院妇科为集医教研为一体的综合学科，科室现有医护人员24人，拥有临床经验丰富的主任医师2人，副主任医师5人，主治医师1人，主管护师5人，其中博士研究生1人，硕士研究生5人。可接诊所有妇科疾病，如肿瘤、内分泌疾病、炎症性疾病以及不孕不育疾病等。
科室配有超高清宫腔镜系统、超高清腹腔镜系统及裸视3D腹腔镜系统，开展腹腔镜下各类良恶性肿瘤手术，如：腹腔镜子宫肌瘤剔除术、腹腔镜下卵巢肿瘤手术、腹腔镜下全子宫切除术、腹腔镜辅助阴式切除术等；宫腔镜下各类手术，如：子宫内膜电切，粘膜下肌瘤电切，内膜息肉电切，节育器残留、节育器异位取出、宫腔粘连分离子宫纵隔切除等以及经腹手术及经阴手术。
妇科门诊设有普通妇科门诊、宫颈专科门诊、青春期及围绝经期门诊，不孕不育门诊，以及计划生育手术室、阴道镜检查及宫颈治疗室，为广大女性身心健康提供优质服务。
（二）产科
产科由产前区、产房和爱婴区及产科门诊组成，床位49张，其中包括LDR一体化待产分娩及修养病房2套，爱婴区VIP单人间病房2间。拥有智慧产科系统、数字化胎心监护中央系统、远程胎心监护中央系统、分娩助产导航系统、彩色多普勒超声诊断系统、产后盆底康复治疗系统、分娩镇痛仪、妊高症监测仪、脐血流监测仪、多功能监护系统等等。先进的临床诊疗监护设备和过硬的产科医护技术团队为母婴安全提供了强大保障。
产科专业人才是科室发展的基础，现有工作人员66名，其中主任医师2名、主任护师1名、副主任医师4名；博士1名；硕士生导师及博士后合作培养导师1名。学科带头人在哈佛医学院全球医院精英管理培训一年及哈佛医学院附属医院访问学习，在同济医学院附属同济医院和上海国际和平妇幼保健院进修学习深造。
医院是全国“乙肝母婴零传播工程”项目医院之一，自2015年至今乙肝母婴传播率为0。2009-2020年深圳市308例HIV阳性孕产妇母婴阻断成功率远低于世界卫生组织制定的＜2%的目标。产科承担和参与了母婴阻断相关的大型多中心国际合作项目2项，“十三五”国家传染性疾病科技重大专项研究子项目2项，省、市级科技项目15项，发表专业论文80余篇，出版专著7部，获得专利5项。
组织了“乙肝母婴阻断新进展学习班”、“血源性感染性疾病妊娠期防控新进展学习班”“妊娠期高血压疾病防治新进展专题高峰论坛”“围产保健新技术高峰论坛”“产科急危重症孕产妇救治新进展学习班”“胎儿宫内监护新进展学习班”“血源性传播疾病孕产妇护理及母婴阻断培训班”，定期请国内外知名专家讲课及手术演示，为同行提供了交流学习平台。