重庆三峡中心医院肛肠外科成立于1957年，历经60余年的发展，现为重庆市中医药重点专科，重庆市中医药重点学科，建有“任东林教授工作室”。

目前，科室占地面积1600㎡，开放床位60张。科室共有医护人员30名，其中主任医师2人，副主任医师3人，博士生导师1人。国家级学术团体任职5人。

科室业务涵盖40余种肛肠盆底疾病，开展30余种手术项目，掌握20余种中医肛肠技术，年门诊人次1.2万人，年手术台次1500余台，业务服务于整个渝东地区，辐射到湖北、陕西、四川、贵州等省。配备有：电子纤维结肠镜室、盆底良性疾病治疗室、肛肠测压室、炎性肠病治疗室、熏洗坐浴室、理疗室、超声清创室，换药室。

科室承担省部级课题3项，发表SCI论文3篇，专著1部、发明专利1项。每年培养肛肠专业人才10余人。

科室医疗技术、教学能力、科研水平均居全市前列。