重庆市妇幼保健院儿童保健科创建于1985年，包括儿童健康普通门诊、专科门诊、早期发展训练中心和高危儿预防接种门诊，是集预防、保健、科研、教学和管理一体的专业学科，提供全面、系统、从预防到治疗的各种儿童保健服务。
完成国家级、市级科研课题20余项，核心杂志论文发表40余篇，曾获得“亨氏杯”中国妇幼营养与保健科研成就奖三等奖、重庆市卫生局科技成果二等奖、重庆市科技进步奖三等奖和原卫生部“儿童早期综合发展项目中心”等奖励或光荣称号，是国家儿童早期发展基地、国家级生长发育健康教育示范基地、重庆市婴幼儿养育照护指导中心、重庆市儿童营养重点专科及重庆市卫健委指定的“儿童残疾诊断中心”。
本科承担全市0-6岁儿童健康管理的业务指导、技术培训、基层督导与质控等工作；承担全市各级托幼园所的卫生保健管理和业务指导工作，成立“重庆市托幼机构协作组”重点提高本市一级幼儿园的技术水平，发挥引领示范作用；承担全市残疾儿童诊断、新生儿疾病筛查、儿童死亡评审、各种国家公共卫生服务项目如营养包项目的计划、实施、质控和总结。本科每年开展多次各级各类技术培训班，广泛接受市内外儿保医生、儿科医生、儿保护士和早教老师的进修学习，切实提高基层儿童保健水平。
1、营养过敏专科：营养过敏专科开展10余年，针对肥胖、超重、消瘦、身高/体重增加不足、体重增长过速、食物过敏等儿童，纳入营养专案管理。根据患儿基础信息、体格测量、膳食调查、饮食行为调查、口腔功能评估、神经发育评估以及其他检测的结果，结合其年龄、行为及心理发育特点，精准诊治、干预及随访。干预过程中制定具体的个体化食谱，进行一对一的饮食行为的指导。
营养专科开展过敏诊治，是全市第一家针对过敏高危儿开展过敏预防研究和临床干预的科室，通过一系列的家长健康教育和预防指导、严谨的诊断（皮肤点刺试验、饮食排除治疗、食物激发试验）、严格的饮食管理，同时辅以局部治疗、免疫治疗和心理治疗，不断改善过敏高危儿或过敏儿童及其家庭的生活质量。
2、心理行为专科：采用多种量表或软件如Gesell、Bayley、韦氏量表、情绪量表、气质量表、适应能力量表、多动症量表、孤独症筛查量表、孤独症诊断量表、焦虑抑郁量表等对体检儿童的发育商/智商、气质、各种能力等进行定期的综合评估、早期筛查，给予预见性指导；对有多动症、孤独症谱系障碍、学习困难和各种行为问题（爱哭、胆小、咬手指、遗尿等）的儿童进行筛查、评估以及生物反馈、感觉统合、视听训练、心理咨询、药物以及家长课堂等综合治疗。
3、睡眠专科：睡眠专科运行已10余年，2015年成为国家卫生行业标准项目“儿童睡眠问题筛查和干预指南”的起草单位之一。主要针对各种睡眠问题儿童，如频繁夜醒、夜哭、睡眠不安、夜惊、梦魇、磨牙、睡眠节律紊乱等儿童，进行儿童和家长的睡眠问题评估、睡眠质量评估、生长发育评价、心理发育评估和气质情绪测试，给予针对性的睡眠卫生指导、知识宣教、行为矫治和家长心理辅导，保障宝宝的有效睡眠，充分促进身心健康。
4、生长发育专科：科室率先在全市开展生长发育门诊，至今已有十余年，主要针对矮身材、身材偏矮或身高增长不足的儿童进行骨龄、生长激素、甲状腺素、性激素、垂体、染色体等内分泌或影像学检查，寻找影响身高的各种影响因素，如甲状腺功能低下症、生长激素缺乏症、营养不良等，给予针对性地合理治疗和追踪随访，改善儿童身高，最大的发挥每个孩子的生长潜能。
5、高危儿/早产儿专科：主要针对早产儿、低出生体重儿、巨大儿、脑损伤、大运动落后、精细运动落后、语言落后等高危儿，开展生长发育、神经心理发育、行为问题、营养喂养、神经运动能力、大运动、精细运动、口腔功能等综合评估和早期综合干预训练（早期、连续、系统、一对一的大运动训练、精细运动训练、作业训练、推拿按摩治疗、语言训练和感觉统合训练等），通过定期纵向随访，有效减少或减轻脑瘫和智力低下等严重疾病的发生。重庆市妇幼保健院是全市唯一进行纵向、全生命周期的高危儿干预管理，从孕期、产时、产后进行全方位儿童早期发展促进，最大限度的提升每个儿童的潜能。
6、早期综合发展训练中心：一方面，对健康婴幼儿进行系统、独特、科学合理的0-3岁儿童的早期综合发展训练，包括亲子抚触、亲子游戏、奥尔夫音乐、美劳训练和蒙氏学习等。另一方面重点针对早产儿、低出生体重儿、巨大儿、脑损伤、大运动落后、精细运动落后、语言落后、多动症等高危儿和问题儿童进行大运动、精细运动、感觉统合训练等开展课程。每周六举办免费家长讲座。本中心是重庆医疗系统早期教育老师的主要进修机构，已接受全国各地200多名教师进修，受到同行的一致认可和好评。参与完成“中国早期儿童发展实用性研究项目”，成为原卫生部指定的“儿童早期综合发展项目中心”。
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