重庆市中医院针灸科创建于上世纪五十年代，由全国著名针灸中医专家吴棹仙、万云程、柳励吾、丁午等创立，是重庆市最早成立的针灸科室。吴棹仙先生向毛主席敬献子午流注环周图，成为毛主席关心支持中医药事业的一大标志性事件，载入史册。

我科经70余年传承、几代针灸人的努力，现为国家区域中医（专科）诊疗中心、国家临床重点专科（中医专业）、国家中医优势专科、国家中医药管理局“十五”、“十一五”、“十二五”重点专科、全国针灸临床研究中心重庆分中心、重庆市中医名科、重庆市卫生健康委中医药“十二五”、“十三五”重点学科、重庆市针灸质控中心。承担全国名中医王毅刚名老中医药专家传承工作室（含全国中医药传承博士后工作）、国家中医药管理局王竹行名老中医药专家传承工作室、重庆市王竹行名中医工作室、重庆市和全国博士后科研工作站（针灸专业）、重庆中医研究院针灸研究所、重庆市中医（痹病）特色诊疗技术工程中心、重庆市中医药传承创新团队、巴渝王氏针灸流派传承工作室等科研及学术平台的建设工作。与成都中医药大学、重庆医科大学中医药学院、湖南中医药大学、贵阳中医学院等高校联合培养针灸专业硕士研究生，承担国家中医住院医师规范化培训任务。

团队现有医、护、康人员76人，其中医师23名，全国名中医1名，全国名老中医学术经验继承工作指导老师2名，重庆市名中医5名，重庆市针灸推拿学学术技术带头人3名，重庆市针灸推拿学带头人后备人选1名，中组部“西部之光”访问学者1名，重庆市高端人才及中青年高端人才各1名，硕士生导师3名，院级青年拔尖人才4名，院级青年巧匠4名；团队有主任中医师13人，副主任中医师3人，高级职称15人，占比55.55%；有博士5名，含博士后2名，硕士以上学历占比51.85%；中医执业比例100%。是一支中医技术力量雄厚、梯队合理的中医针灸临床、科研、教学队伍，在西南地区及全国均享有声誉，2018年、2019年连续获得艾力彼中国中医医院最佳临床中医专科殊荣，在2022年度全国中医科学院专科学术影响力排行榜排名全第16位，位居西南地区第一。

我科以针灸中药结合诊治80余种常见病、多发病及疑难病，疗效显著，处于国内先进水平。以中风（脑梗死、脑出血、脑栓塞等）、痹病（各类疼痛包括颈椎病、肩周炎、腰椎间盘突出症、软组织损伤、骨性关节炎等）、不寐（各种病因导致的失眠症）、面瘫为优势病种，临床疗效在国内处于先进水平，中医优势病种门诊量逐年增加。年均门诊人次达15万人次，出院人次达2000人次。具有综合救治危急重症的能力，诊治10余种罕见疾病。

我科长期进行中医药传承工作，先后开展中国中医科学院传承博士后、全国名老中医药专家学术经验继承人、全国中医临床优才、重庆市“中医优才”和全国博士后等培养工作。每年承担成都中医药大学本科黄星垣班针灸操作培训任务，承担重庆医科大学、重庆医药高等专科学校、三峡医药高等专科学校、遵义医药高等专科学校等本科生的临床实习带教任务，年带教实习生300余人次；近5年来与成都中医药大学、重庆医科大学中医药学院、湖南中医药大学等联合培养硕士研究生20余名；承担中医住院医师规范化培训300余人次/年，接受市内外进修生40余名，承担每年承担国家级继教级市级继教项目多项。近5年以来主持国家自然科学基金1项，中国博士后基金1项，重庆市博士后基金1项，省部级课题21项，获得科研经费600余万元，发表论文50余篇，取得专利11项，获得科技奖励2项。

现有业务用房3950m2，设有门诊9间和2个病区，编制床位124张，建有康复中心、灸疗中心。现为中国针灸学会科普基地，建有针灸国际交流区，展示针灸历史浮雕及文化长廊等，已承办了驻渝使领团的中医药文化体验，年均接待参观交流数十次。在巴巴多斯援外医疗期间建立了“中医药文化中心”；在巴布亚新几内亚援外医疗期间多次开展“针灸文化周”活动，多人赴美国、意大利、瑞士、新加坡等国交流，更广泛地传播了中医针灸文化和技术。