重庆医科大学附属第二医院疼痛科，是在脊柱中心的基础上成立的专门诊治慢性疼痛性疾病的临床科室。设有疼痛门诊，疼痛病房，病房设置床位３０张。
年门诊患者逾万人次，收治病人１５００余人，开展手术１０００余台。门诊还设置有疼痛治疗室，配备８张治疗床，门诊常规开展冲击波治疗、微波治疗、红外线治疗、中频治疗仪、牵引治疗、经皮电刺激治疗等物理因子治疗。
目前科室医护人员共２２人，其中主任医师（教授）１名、副主任医师（副教授）２名，硕士生导师２名，副主任护师１名，主管护师３名。是重庆市疼痛质控中心，重庆市中西医结合疼痛专委会主任委员单位，重庆市医学会疼痛学分会副主任委员单位。科室全体医师具有硕士以上学位，其中博士学位的医师占比９０％，全部护士具有本科及以上学历。
科室技术力量雄厚，诊疗技术先进。已常规开展脊柱内镜手术、鞘内镇痛泵植入手术、脊髓电刺激植入术、椎间盘射频、神经射频、臭氧治疗以及神经阻滞镇痛等手术操作。并以脊柱内镜等微创手术为龙头，形成了重医附二医疼痛科治痛特色。
科室诊疗范围为以下七大类慢性疼痛：原发性疼痛、术后和创伤后疼痛、肌肉骨骼疼痛、癌性疼痛、头与颌面部疼痛（三叉神经痛）、神经病理性痛（带状疱疹性神经痛）与内脏疼痛。