成都军区总医院全军普通外科始建于1959年。近五十年来，经几代人的艰辛努力，目前是全军胰腺外科重点实验室，四川省甲类重点学科，成都军区胰腺疾病研究所，第三军医大学、重庆医科大学等医学院校的硕士及博士培养点，国家人力资源和社会保障部授予的博士后科研工作流动站，有硕士及博士导师7人，已培养博士研究生14人，硕士研究生18人。
科室设有胆道外科、胰腺外科、微创外科、肝脏外科、胃肠外科及重症监护科等六个专科，共开展床位250张，有医护人员170多人，其中博士16人，硕士13人，主任医师及副主任医师19人，留学归国人员3人。主要开展胆道、胰腺、肝脏及胃肠道疾病的外科治疗，尤其是在急性胰腺炎、胆道疾病的微创治疗、复杂胆道疾病的手术治疗、胆道肿瘤的外科治疗、糖尿病的外科手术治疗等领域在国内外形成了显著的医疗特色和优势。
近十年来，科室先后获得军内外各类科研成果36项，在国内外学术刊物上发表论文近600篇。其中，获全军医疗成果一等奖一项(2004年)、四川省科技进步一等奖三项（2003年、2006年及2009年）、全军科技进步二等奖五项；获得各类科研基金如国家自然科学基金、全军“十一五”重大科研项目基金、全军杰出青年基金、四川省科研计划项目基金等近500多万元。
胰胆外科主治胰腺及胆道外科疾病，设床位100张，分为胰胆一，胰胆二两个病区，可开展全胰切除、胰头癌根治术，胰胆管结石手术，该科在全国最早开展内镜胆胰管减压治疗急性胰腺炎，并列双U形管治疗胰周脓肿，窦道空肠吻合治疗慢性胰瘘。以及胰腺胆道疾病联合治疗。
以上技术获得国家及军队科技进步奖。在慢性胰腺炎的综合治疗，胰腺癌早期诊断，胰腺癌疼痛治疗及腹腔镜胆囊切除术方面等都有独特之处。该科与香港达隆公司合作研制的热缓释胰腺癌治疗仪，获得国家发明专利。近年开展手术治疗糖尿病项目，是西南地区首家开展外科治疗糖尿病首家医疗机构，目前糖尿病治愈率高达90%。
腹部微创外科
成都军区总医院普通外科1980年开始以纤维十二指肠镜，胆道镜为主体，开始了腹部外科疾病的内镜治疗，在国内外最早使用纤维十二指肠镜取出完全进入胆管的蛔虫，在10钟内完全治愈胆道蛔虫，深受患者欢迎。到目前为止已治疗1400多例病人，成功率97%。波兰，印度，巴基斯坦，南非等国同道多次来函索取资料。成都军区总医院普通外科也是国内最早开展内镜乳头括约肌切开术的医院之一。
由于有胆道外科手术作为坚强后盾，使这项技术一直保持在国内领先水平，成功率达98%。在全国最早开展经皮内镜胃造瘘术（1984年），是用内镜代替剖腹胃肠手术的成功尝试，目前已开展48例。1989年，出版了国内第一部内镜外科专著《腹部内镜外科》。
成都军区总医院普通外科1989年开展了经皮胆囊镜超声碎石技术，这是用微创技术治疗胆囊疾病的初步实践，这项技术很快被风糜全球的电视腹腔镜胆囊切除术所取代，成都军区总医院普通外科继昆明总医院之后，于1992年开展了此项技术，目前也积累了3000多例的经验。介入B超治疗腹部外科疾病也是深受患者欢迎的技术，早在80年代初，该科室就开展了介入B超治疗肝脓肿，脾脓肿，腹腔脓肿及肝、肾囊肿，肝癌的导向注射等等。20年来为1800多位患者解除了病痛，免除了开刀之苦。
上述微创技术的成果，成都军区总医院普通外科先后获得了军队科技进步二等奖一项，四川省科技进步二等奖一项，军队医疗成果二等奖一项以及6项三等奖。
目前由内镜技术，腹腔镜技术及介入B超技术联合而组成的腹部微创外科研究室已初具规模，正在继续探索不开刀或开小刀治疗腹部外科疾病的新技术。
自1988年Dubois报告36例手术经验后，腹腔镜胆囊切除术迅速在全球普及。国内从1990年左右就始了腹腔镜胆囊切除术，腹腔镜肝叶切除等，手术数量急骤快速上升。成都军区总医院普通外科开展腹腔镜治疗数十年，完成手术上万例。科室近年开展单孔腹腔镜手术近百例，深受广大患者好评。
成都军区总医院胃肠外科是全军的普外科室，近几年来，全体医护人员秉承“姓军为民，病人第一”的宗旨和“生命相托，永不厌弃”的理念，按照“创新发展、技术引挚”的思路，瞄准国内外胃肠外科前沿高精尖端技术，采用“筑巢引凤，强强联合”的方式，实现了成都军区总医院胃肠外科跳跃式跨越式地发展，如今，成都军区总医院普通外科不仅成为四川省首批重点学科，而且被国务院确定为“博士后工作站”。
成都军区总医院胃肠外科主要诊治胃癌、结肠癌、直肠癌、消化道出血、各种疝，便秘等胃肠疾病，现定编床位60张。现有医务人员30名，其中高级职称4人，博士3人，硕士1人，全年住院人数达1500人次，其中1/3以上的病人来自全国全省各地的转诊病人，平均住院日为10天，好转率和治愈率达98％以上。
近几年来，成都军区总医院胃肠外科重视技术创新，除常规开展开腹手术外，还开展腹腔镜下远近半胃切除，全胃切除术，腹腔镜下左右半结肠切除术，全结肠切除术，直肠切除术。腹腔镜技术是腹部外科微创技术的代表，它具有创伤校，恢复块，术后并发症少，治愈率高等优点。如今，成都军区总医院胃肠外科已全面和熟练地掌握了腹腔镜在胃肠疾病方面的应用，成为全国少有的能掌握此项核心技术的医院之一。
成都军区总医院普通外科大力推广开展“无张力疝修补术”，采用先进的人工合成材料，治疗腹股沟疝，股疝，切口疝，脐疝，盆底疝，膈疝等疾病，取得了明显的效果，具有恢复快，复发率低，病人依从性好等优点。成都军区总医院普通外科还大力推广开展“PPH”手术，采用特制的仪器装置，治疗内外痔，彻底解决患者的难言之瘾，患者反应良好。
近几年来，成都军区总医院胃肠外科重视整体医疗，对于晚期胃癌、结肠癌、直肠癌及腹腔肿瘤患者，改变传统单一的化疗模式，采用手术、局部置药、肝脏灌注、新型化疗方案，术中热疗等方法，最达限度地抑制肿瘤细胞的复发和转移，明显减轻了病人的痛苦，大大延长了患者的生命。通过数例的研究对比，晚期胃癌、直肠癌包括肝转移，全身淋巴结转移等，经过规范化的治疗，生存时间率明显延长。
近几年来，成都军区总医院胃肠外科重视人性化和个性化的医疗，对于超低位直肠癌高龄患者，成都军区总医院普通外科采用保肛技术，避免了肛门改道带来的痛苦，保持了患者的生存质量，被广大患者所接受。
如今，成都军区总医院普通外科已制定出发展规划，把“胃肠腹腔镜微创技术”和“胃肠中晚期癌症的综合治疗”作为成都军区总医院普通外科的重点发展项目，成都军区总医院普通外科将投入大量的人力，物力及财力予以支持。患者朋友们，请你们相信，在不久的将来，成都军区总医院胃肠外科将向你们提供国内领先，国际一流的医疗服务，你们的健康将得到强有力地保障。