广州医科大学附属第二医院番禺院区呼吸内科，对呼吸系统常见病、多发病以及危重症抢救均能熟练诊治。诊治范围包括：慢性阻塞性肺疾病、支气管哮喘、支气管扩张、慢性咳嗽、胸部肿瘤、肺部弥漫病变、肺血管病变、尼古丁依赖症（烟瘾）等疾病，以及睡眠障碍诊疗及呼吸康复治疗等。

实验部拥有标准化临床肺功能检测技术、诱导痰细胞学分析检查，为慢性咳嗽、支气管哮喘、慢性阻塞性肺疾病的诊治提供实验室支持；内镜中心拥有多条电子支气管镜协助临床诊治，并逐步开展介入治疗技术（肿瘤治疗、气道狭窄治疗、异物钳取等）。