广东省第二中医院康复科（康复治疗区）成立于2004年，是目前国内综合医院较早成立的、专业水准较高的现代康复治疗学专业部门。本部开展临床各科急性期、早期和重症监护期的床边物理治疗，恢复期的住院康复治疗，同时又为各种患者提供康复教育、咨询和指导等。
目前医院有三大治疗部门——物理治疗部、作业治疗部、吞咽-言语治疗部。共有康复治疗专业人员14人，除了对住院患者进行日常康复训练与治疗外，亦对出院后有康复需求的门诊患者服务，同时指导患者或家属进行家庭康复训练。