武汉市金银潭医院药剂科是集药学服务、药事管理、科研教学为一体的综合型药学部门，设有质量监控室、临床药学室、中心药房、门诊药房、中药房、中药库、西药库、静脉用药调配中心、湖北省艾滋药品库、武汉市艾滋药品库、单剂量分包室等部门，负责药品质量安全，服务患者和临床，促进合理用药，开展药物调剂、中药煎制、药学门诊、药物咨询、处方点评、药物不良反应监测、合理用药分析等专业工作。
科室专业技术梯队、年龄结构、学历层次合理，高级职称3人、中级职称以上占77%；硕士5人，本科学历以上占74%。武汉市中青年骨干人才1人，省市各级药学专业协会任职6人。获得武汉市重大科技成果一项，武汉市科技进步三等奖一项。
药学部一直致力于打造具有金银潭特色的中西结合药学学科，现为湖北省药品不良反应（事件）监测评价哨点医院，管理医院5个中药特色制剂，多个特色中医协定方（新冠治疗方、阵咳方、防疫袪瘟香囊、安神益智香囊等）。
始终贯彻“以病人为中心，以合理用药为核心”的理念，重视学科管理体系建设，强化药事管理职能，实行药品管理标准化和药学服务规范化，医、教、研协同发展，提升医院药学服务水平。