吉林大学第三临床医院耳鼻咽喉-头颈外科学下设耳科、鼻外科及颅底外科、鼻变态反应科、咽喉科（睡眠呼吸疾病科）、头颈外科等5个亚临床学科，其中鼻外科及颅底外科、鼻变态反应科、头颈部肿瘤的综合治疗处于国内一流水平，早在上世纪60年代始就进行经鼻颅底肿瘤手术，成为鼻颅底外科和鼻眼相关外科的开拓者。

迄今出版专著4部，近五年参加编写耳鼻咽喉科教材5部，部级奖励多项。近三年SCI文章5篇、核心期刊论著总数达50余篇。

现已拥有60余张床位，具有现代化的手术室及门诊病房，医疗技术先进、医疗服务覆盖东北三省及内蒙古地区的学科。吉林省耳鼻咽喉科重点实验室。

共有27名医生，14名获博士学位，4名在读博士。博士生导4名，硕士生导师10名。

1984年，成为国内较早获得耳鼻咽喉科博士授权单位，共培养数十名博士，早期培养的博士如今已成为国内多个院校学科带头人。

国家卫健委重点建设学科，国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心-吉林省分中心，2022年国家临床重点专科项目-颅底外科疾病诊疗能力提升项目，省级重点实验室2个，国家鼻内镜培训中心。

2023年国家耳鼻咽喉疾病临床医学研究中心-吉林省分中心，2022年获得国家临床重点专科项目-颅底外科疾病诊疗能力提升项目

具有省级以上重点实验室2个：

--吉林省上气道过敏性疾病精准诊疗实验室；

--吉林省鼻及鼻颅底外科相关纳米及生物材料工程研究中心。

科室在中心院区、南湖院区和北湖院区共设三个疗区，实行三地一体化管理。科室门诊位于8号楼2楼耳鼻咽喉头颈外科门诊，住院病区位于7号楼19楼耳鼻咽喉头颈外科病房。