黑龙江中医药大学附属第二医院针灸科具有近二十年的发展历史。该科室医疗技术力量雄厚，承担着针灸、神经内科门诊及病房的临床诊断、治疗、预防、保健、健康教育等工作。病房内现有医生9人，主任医师1人，副主任医师2人，主治医师1人，住院医师4人，护士10人，副主任护师1人。该科是在项针治疗真、假性延髓麻痹症方面，处于全国领先地位。作为国家中医药管理局假性延髓麻痹中医临床路径协作组组长单位，制定的假性延髓麻痹中医临床路径目前在全国推广使用。在治疗中风偏瘫、夹脊电场疗法治疗脊髓性截瘫、针灸治疗周围神经疾病(如眼肌麻痹，面瘫，面肌痉挛，三叉神经痛)、电针治疗排尿障碍(神经源性、前列腺增生、前列腺炎引起)，电项针疗法治疗脑部疾病(如头晕、眩晕、耳鸣、耳聋、失眠症，颅内高压综合征、脑积水等)、夹脊电针疗法治疗颈椎病及腰椎病、以及一些疑难杂症疗效显著，新闻界多次给予报导，在国内外都享有很高声誉，形成良好的社会效应。