肛门体检可以检查出肛管腔内及肛门周围的病变，也可以检查出低位直肠腔内的病变。通过肛门的视诊可以观察肛门周围有无异常的分泌物，以及肿物、肿块等，检查是否有痔疮、肛裂等疾病。 通过触诊可以触摸肛门周围有没有瘘管、硬结、肿块，通过指诊可以触及肛门内有没有痔疮、肥大的肛乳头、低位息肉以及肿物等，还可以检查出肛门的松紧度，以及是否有直肠前突等。 另外男性可以通过肛门指诊检查到前列腺的形状及软硬度，女性可以通过肛门指诊检查到子宫的形状及软硬度。