中国医科大学附属第一医院传染科分为传染一科和传染二科
传染一科（感染性疾病一科）
中国医科大学附属第一医院传染一科建立于1996年5月，先后获批国家卫健委“细菌真菌感染诊治培训基地”和辽宁省“感染性疾病医疗中心”，为“辽宁省医院感染管理质控中心”挂靠单位。多年来形成了医院感染诊断治疗与预防控制为一体的学科体系。

科室现有医护人员29人，其中教授3名、副教授7名，博士导师1名，硕士导师7名，编制床位42张。传染一科秉承“治感染表里兼顾/诊发热内外双修”业务要求和理念，拥有对各种感染性疾病（infectiousdisease），包括法定传染病（communicabledisease）的诊治能力。专注不明原因发热（FUO）的病因诊断、发生于院内外的各器官、系统复杂、难治和耐药菌感染的诊治；对抗生素合理应用具有相当造诣。
传染二科（感染性疾病二科）
传染二科为辽宁省高等学校重点学科，先后承担包括6项国家自然科学基金、1项卫生部临床重点项目等15项科研基金。近3年来发表传染病相关文章30余篇，SCI收录论文10余篇，获得省科技进步二等奖1项。临床上专注各种肝病、传染性疾病、重症感染的诊断治疗，尤其对重型肝炎的抢救治疗和危重传染病，特别是多器官功能衰竭的治疗有较深入研究。2020年通过国家审核成为国家传染病区域医疗中心。