上海市第五人民医院神经外科前身为1960年由市中心迁至闵行地区的上海市第五人民医院大外科下属的脑外科组。2003年独立设科，收治各类颅脑外伤及合并伤、颅脑肿瘤、脑血管病变等。2005年5月11日正式挂牌成立为复旦大学附属华山医院。神经外科集团医院市五分院，各项业务全面开展。分院院长由华山医院著名的李士其教授担任，主持分院各项工作。2007年评为闵行区特色科室。现为复旦大学华山医院-复旦大学附属上海市第五人民医院医联体。华山医院神经外科李士其教授、郑康教授为特聘教授。科室床位36张，设有重症病房、VIP病房，配置有进口神经外科手术显微镜、脑室镜、神经内窥镜、专用手术床及手术头架、专用手术动力系统、显微手术器械、颅内压监护仪、进口呼吸机、心肺监护仪、电动降温毯、微量注射泵、微量输液泵等先进设备。团队架构科室技术力量雄厚，现有华山医院特聘教授2人，神经外科医生9名，主任医师、教授1名，副主任医师、副教授1名，主治医师6名，住院医师1名。科室特色李士其教授擅长垂体瘤的微创手术，具有创伤小，疗效好、安全性高，恢复快的特点，在神经外科界颇具知名度。众多上海本地及周边省市的患者慕名来就治，垂体瘤手术也成为神经外科的一大特色。黎军教授师从李士其教授，在垂体瘤微创手术上也有较深的造诣。郑康教授在各种颅内肿瘤、椎管内肿瘤的显微神经外科手术上有很深的造诣，是华山医院神经外科较有影响力的教授。黎军教授开展的显微血管减压术治疗三叉神经痛、面肌痉挛、舌咽神经痛，手术创伤小，根治率高，是神经外科的另一特色。脑动脉瘤、动静脉畸形、颈动脉狭窄的介入治疗和显微手术治疗。在闵行区最早开展，拥有成熟、完善、先进的各类脑血管病诊疗手段。其中神经血管介入由黄山教授团队负责，脑血管病特别是复杂脑动脉瘤显微夹闭手术由科主任黎军教授带领团队负责。脑深部电极植入术（DBS）治疗帕金森氏病，取得较理想的效果。手术例数在上海市也名列前茅。开展正常压力性脑积水的诊断和治疗，可以使一部分痴呆患者改善，提高生活质量。科室常规开展脑膜瘤、胶质瘤、椎管内肿瘤、海绵状血管瘤切除术、听神经瘤切除术、桥小脑角囊肿切除术、动脉瘤夹闭术、小脑动静脉畸形、查理士畸形等多项神经外科显微手术手术，效果良好。神经内镜微创手术也是是神经外科的特色之一。教学、科研情况承担复旦大学公共卫生学院、皖南医学院临床医学、南通大学杏林医学院医学生的大课教学、见习和实习，复旦大学外科学研究生带教以及上海市住院医师规范化培养外科基地神经外科带教工作。2013年通过了临床药物试验机构专家组的现场认证和验收，成为临床药物试验机构专业组。