复旦大学附属上海市第五人民医院消化内科为硕士授予点，共有医生12人，其中主任医师2人，副主任医师3人，主治医师3人，住院医师4人，具有硕士学位8人。每年门诊量80000人次以上，消化内镜15000人次以上，出院1000人次左右。

20世纪80年代初我院较早开始引入并开展纤维内镜检查技术，为消化道疾病的诊断与治疗提供了可靠的方法，消化内镜及内镜下活组织检查是目前公认的诊断食管、胃、肠道肿瘤的金标准，近几年来，我院早期胃癌的检出率在20%左右，处于较高水平；消化内镜除了用于常规的检查外，目前消化内镜广泛用于内镜下的治疗，我科已常规开展非食管静脉曲张并急性活动性出血的内镜下治疗、食管静脉曲张的硬化剂、圈套治疗，其他如内镜下取异物、植入支架、息肉摘除、超声内镜等已成为常规诊疗手段，胶囊内镜检查的开展为诊断小肠疾病的诊断提供有效的手段；我科还常规开展ERCP（经内镜逆行胰胆管造影）检查及乳头肌切开取石术、消化道早期肿瘤粘膜剥离术（ESD）等高难度的诊治技术，为成功诊治胆胰疾病、早期胃肠道肿瘤提供微创的有效诊治手段。近年来消化科逐步形成以消化内镜的诊治、功能性胃肠病、肝硬化腹水、急性胰腺炎、缺血性肠病的诊治为特色，服务广大闵行百姓。

消化科参与每年皖南医学院临床医学系《内科学》的授课，接受复旦大学公共卫生学院、皖南医学院临床医学系学生的实习带教，带教住院医师规培基地的学员，如内科基地、全科及其他基地的学员。

消化科每天均开设专科和专家门诊。