南阳市中心医院中医科是建院后最早成立的专业科室之一。现有医护人员20名，中医专业医师14人，其中主任医师2名，副主任医师2名，主治医师3人，研究生10人，南阳市退休名老中医三名。

设立中医内科门诊2个，妇科门诊2个，中医男科门诊1个，中医内分泌、消化门诊1个，由高级职称中医师常年坐诊，实行门诊病房全程服务。

中医科多年来采用中西医结合疗法开展了对糖尿病及其并发症、甲状腺疾病、消化系统疾病、心脑血管疾病、呼吸系统疾病、风湿免疫性疾病等的诊疗。

河南省中医重点专科“南阳市中心医院中西医结合内分泌专科”设立在中医科。同时在院内开展中西医协同诊疗工作，常年参与院内各内科、外科、妇科、儿科、感染科、肿瘤科、及ICU等临床科室的中医会诊工作，月会诊量达1500多例，取得了医患满满的效果。