黑龙江省疾病预防控制中心是政府设置的实施疾病预防控制与公共卫生检验和服务的公益性事业单位，是全省疾病预防控制和卫生检验和服务的公益性事业单位，是全省疾病预防控制和卫生检验的中心机构和技术指导中心。

黑龙江省疾病预防控制中心在卫生行政部门领导下主要职责有以下几方面：

一、在黑龙江省卫生和计划生育委员会的领导下，完成国家下达的重大疾病预防控制的指导性任务，实施本省疾病预防控制的指令性任务，实施本省疾病预防控制规划方案，对重大疾病流行趋势进行预测，制定计划免疫工作计划，负责全省疫苗管理，负责对免疫接种副反应及事故进行诊断与鉴定。

二、组建应急处理队伍，指导和参与重大突发公共卫生事件调查与处理。

三、开展病原微生物检验检测，从事毒物与传染物的检验鉴定和毒理学检验。

四、指导全省健康教育与促进和社区卫生服务工作。

五、承担应用性科学研究，推广先进技术，参与拟定国家公共卫生相关标准。开展对市县级疾病控制机构的业务指导和人员培训，组织实施市县级疾病预防控制机构业务考核。

六、组织开展公共卫生健康危害因素和疾病的监测、评价；建立省级网络平台，管理全省疫情及相关公共卫生信息网络，开展预测预报。

七、组织实施全省急性传染病、慢性非传染性疾病、寄生虫病、地方病和媒介生物的预防与控制，负责从业人员健康检查和卫生知识培训。

八、承担省卫生行政部门交付的其它任务。