医院始建于1988年4月，2015年与上虞区计划生育指导站合并，成立绍兴市上虞妇幼保健院，是一家集临床医疗、教学、科研与妇幼保健为一体的三级乙等专科医院；是全区妇幼保健工作的指导中心和妇产科技术指导中心、计划生育服务中心和新生儿疾病筛查管理中心；是绍兴地区首家全国PAC优质服务医院，国家卫健委第一批分娩镇痛试点医院；是浙江省儿童早期发展基地，浙江省家长健康教育基地，浙江省示范孕妇学校，新生儿先天性心脏病筛查点。1993年被命名为国家级爱婴医院，2006年通过“二级乙等妇幼保健院”评审，2013年2月成功升级为“三级乙等妇幼保健院”。

医院占地面积26230平方米，建筑面积31855平方米，现有职工461人(不包括退休返聘)，其中卫技人员381人，高级职称78人，中级职称161人，保健人员68人。核定床位300张，实际开放床位210张，重症医学床位5张。设置四大部，7个病区，23个临床科室和10个医技科室。

医院的发展得到了各级领导的关怀支持和精心指导。获得了2018年浙江省爱卫会健康促进医院、2021年绍兴市第二批“五星三名”示范医院等荣誉。与国内多家医院建立了院际合作关系，2012年成为上海红房子妇产科医院协作医院，2016年成为绍兴市妇幼保健院医疗联合体成员单位，2020年成为浙江大学医学院附属儿童医院合作医院，2021年7月对口帮扶四川省乐山市金口河区妇幼保健院，2021年9月成为浙江大学医学院附属妇产科医院上虞分院。