新疆生产建设兵团总医院呼吸内科是省级重点专科。擅长各种肺炎、慢性阻塞性肺病，支气管哮喘以及肺心病、肺癌、间质性肺病、胸膜疾病、睡眠呼吸障碍、肺栓塞、重症肺炎、呼吸衰竭等疾病的诊治，2017年成立了“国家呼吸临床研究中心·中日医院·新疆生产建设兵团呼吸专科医联体”，2017年成立了新疆首个肺移植受体筛查中心，同时与国家远程医疗中心合作并经其授牌成立国家远程医疗与互联网医学中心新疆兵团协同中心，开展远程会诊、教学、转诊等系列工作。

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