复旦大学附属华山医院抗生素研究所，是教育部首批传染病学科博士点、重点学科，国家卫健委抗生素临床药理重点实验室和首批确定的抗感染药临床药理基地，牵头全国细菌耐药监测网CHINET，牵头创立中华医学会细菌感染与耐药防治分会。研究所长期致力于感染性疾病诊治、抗感染药物临床药理学研究和细菌耐药性防治，临床实践与实验研究密切结合，学风严谨、注重传承，对提高我国的细菌真菌感染诊疗水平及抗菌药物临床应用水平起到了较大贡献。

临床工作一直是抗生素研究所的核心工作之一。抗生素研究所在华山医院多个院区开设感染门诊（感染与抗生素应用专病门诊），在总院开设多重耐药菌感染多学科门诊。在总院、北院和浦东院区拥有收治各类型细菌真菌感染和发热待查患者的感染病房。承担大量院内外疑难、危重感染诊治和抗菌药物合理应用的会诊工作，每年会诊近5000例次，其中院外（本市及全国各地）1500余例次。研究所临床医师还兼任华山医院的医院感染控制科主任和抗菌药物合理应用管理小组负责人。

研究所在长期的临床医疗工作中涌现了戴自英（著名传染病学专家，中国临床抗生素学的奠基人、抗生素研究所创始人）、刘裕昆、汪复（抗生素研究所名誉所长）、张婴元（抗生素研究所前所长、终身教授）和王明贵（抗生素研究所所长）等一批国内外着名临床专家。抗生素研究所临床应用室现有主任医师6名（王明贵、杨帆、黄海辉、吴菊芳、徐晓刚、林东昉），副主任医师5名（陈轶坚、赵旭、袁瑾懿、王明华、秦晓华），主治医师5名，住院医师3名。杨帆任临床应用室主任，林东昉、陈轶坚为副主任。

研究所临床医师具有感染病、临床微生物学及临床药理学等多方面综合知识，掌握各类感染的常见病原体及其耐药情况，熟悉各类抗菌药物的特性，在大量的临床工作中积累了丰富的感染性疾病诊治经验，从而提高感染性疾病的治愈率，做到抗菌药物的合理使用、减少抗菌药物不良反应。抗生素研究所临床药理室、临床微生物室为精准治疗提供了治疗药物监测、联合药敏等有力的实验室支撑。

抗生素研究所擅长以下感染性疾病的诊治：

 ⑴下呼吸道感染：急性支气管炎、慢性支气管炎急性发作、支气管扩张继发感染、各类肺炎、肺脓肿等；

 ⑵上呼吸道感染：细菌性鼻窦炎、化脓性扁桃体炎和咽炎、急性中耳炎等；

 ⑶泌尿生殖系统感染：各类尿路感染（尿道炎、膀胱炎及肾盂肾炎）、前列腺炎、肾脓肿等；

 ⑷消化系统感染：感染性腹泻、肝脓肿等；

 ⑸心血管系统感染：血流感染（败血症）、感染性心内膜炎；

 ⑹中枢神经系统感染：脑膜炎、脑脓肿等；

 ⑺腹腔、盆腔感染；

 ⑻深部真菌感染； 

⑼免疫缺陷者感染；

 ⑽多重耐药菌感染。