青岛市市立医院消化科在市立医院本部和东院均设有科室：
本部消化内一科
青岛市市立医院消化科是山东省医药卫生重点专业和山东省临床重点专科。市立医院本部消化内一科设有病房、门诊、内镜中心及消化科实验室。共有医护人员30人。其中博士3人、硕士7人，主任医师2人，硕士研究生导师3人。内镜中心拥有先进的电子胃镜、结肠镜、十二指肠镜、超声内镜、胶囊内镜等。
科室对各种消化科疾病如慢性胃炎、消化性溃疡、反流性食管炎、溃疡性结肠炎、急慢性腹泻、急性胰腺炎、慢性胰腺炎、上消化道出血、急慢性病毒性肝炎、药物性肝炎、免疫性肝炎、肝硬化及其并发症、胃肠道肿瘤、肝癌、胰腺癌、恶性胆管梗阻所致梗阻性黄疸、消化道肿瘤的早期镜下治疗等进行及时的诊断并给予规范治疗，包括内镜下微创诊疗技术。
在科主任的带领下，结合临床实际，学习并掌握临床科学研究的基本方法，在肝脏肿瘤和胃癌的生物病因学基础与临床研究方面达到国际先进水平。几年来，立项课题15项，获省、市级科技进步奖10余项，获国家实用新型专利4项；发表论文80余篇，被SCI收录10篇；主编专著6部，参编著作多部。参加多项国内外药品临床试验。
每年培养研究生6名，每年接收见习、实习医师及进行医师100余人。有多名医生先后赴奥地利及北京上海进修学习。对胃肠疾病和肝胆胰腺疾病的诊断治疗积累了丰富的经验。连续多年获医院先进集体称号。科室重视医德医风建设，大力推进人性化服务，多年来连续被评为医院先进科室。
本部消化内二科
青岛市市立医院消化科为山东省医药卫生重点专业和山东省临床重点专科。本部消化内二科现有床位33张，专业技术人员24人，其中主任医师1人，副主任医师5人，中级专业技术职称人员6人，博士3人，硕士3人，硕士研究生导师3人。内镜中心拥有先进的电子胃镜、结肠镜、十二指肠镜、超声内镜、胶囊内镜等。
诊疗范围：包括消化系常见病、多发病、疑难病的诊治，脂肪性肝病、胆汁淤积性肝病、慢性肝炎、各种病毒性肝炎、肝硬化、肝癌的综合治疗，食管疾病、慢性胃炎、溃疡病、慢性腹泻、溃疡性结肠炎、克罗恩病、急性胰腺炎、消化道出血及胃癌、大肠癌等疾病的诊治内镜下微创诊疗术对胃肠肿瘤的早期诊治及肝硬化食管胃底静脉曲张的内镜下治疗。
为国家药物临床试验基地（肝病专业），设有青岛市消化疾病重点实验室。在慢性肝病、肝硬化、肝癌、消化道大出血及内镜下微创诊疗术，如内镜下微创诊疗术对肝硬化食管胃底静脉曲张的内镜下治疗及胃肠肿瘤的早期诊治等方面形成了自己的专业特色。
近年对脂肪性肝病、原发性肝癌的生物病因学及螺杆菌与原发性肝癌、螺杆菌与消化道肿瘤、胃镜下空肠置管术在肠内营养的应用等开展了深入的临床与基础研究，研究水平达到国际先进水平，承担国家自然科学基金等10余项课题，研究成果获得省市级科技进步奖10余项。
发表论文100余篇，其中SCI收录论文20余篇，主编人民卫生出版社等专著10余部，并担任世界华人消化杂志、临床肝胆病杂志、解放军医学杂志、药品不良反应杂志等多家国内核心期刊杂志编委。
承担青岛大学、南京医科大学、大连医科大学、潍坊医学院、泰山医学院等多家单位的硕士研究生带教工作，是多所院校的硕士生培养点，并承担青岛大学、中国海洋大学医学博士培养。承担青岛市市立医院消化专业博士后培养工作，科室成员在职攻读博士学位三名，并定期派人员到国内顶级相关专业机构进修学习。
科室实行人性化的管理模式，提倡快乐工作，各尽其能，一切以病人为中心。实行双语交班，建立学习型团队。
科室文化品牌：“心系肝胆，情暖胃肠”。
东院消化内一科
青岛市市立医院消化科是山东省医药卫生重点专业和山东省临床重点专科。东院消化科设置病床44张，年均门、急诊量30000余人次，年均出院病人近900人次。
现有医生12人，其中正、副主任医师6人，主治医师3人。博士后1人，博士4人，硕士7人。拥有Olympus胃镜、十二指肠镜、结肠镜、NBI、放大内镜等检查设备。
内镜检查开展了电子胃镜、十二指肠镜、结肠镜检查，色素内镜检查，内镜下食管贲门狭窄的扩张和支架置入术、食管静脉曲张硬化剂注射术和套扎术、消化道异物内镜下取出术、消化道息肉内镜下电凝切除术、急性上消化道大出血内镜下止血术、逆行胰胆管造影术、乳头肌切开取石术、胆管狭窄扩张术和支架置入术、胆管狭窄引流术等项目，并在全省率先开展了睡眠胃镜检查和治疗。
对急性重症胰腺炎、肝硬化腹水、肝性脑病、食管胃底静脉曲张破裂出血的治疗疗效显著；对不明原因消化道出血诊断、上消化道大出血抢救方面，经验丰富；对溃疡性结肠炎以及克罗恩病有独到的治疗方法。在胃食管反流病、肠易激综合征、消化道早癌的内镜下诊断及治疗方面有较为深入研究。
担负青岛大学医学院、大连医科大学、潍坊医学院的临床教学任务。