头孢克肟可以用于治疗淋球菌、大肠杆菌等致病菌感染而引起的尿路感染，一般需要吃5-7天。如果情况比较严重，可能用药时间需延长，但尽量不要超过14天。
口服头孢克肟治疗尿路感染，一般3天左右就会起效，患者尿痛、尿频、尿急、排尿困难等症状可得到改善。服用药物1周左右症状可基本消失，如果吃药1周后症状不见好转，可在医生指导下换用其他的消炎药，如诺氟沙星、呋喃妥因等治疗。出现尿路感染建议就医进行尿细菌培养、硝酸盐还原试验等明确具体致病菌，针对性用药。
头孢克肟宜空腹口服，防止食物延迟药物吸收。存在严重肾功能不全的患者要慎用。服用头孢克肟期间严禁饮酒，防止与酒精反应发生双硫仑反应危及生命。饮食尽量选择清淡、易消化，富含维生素和蛋白质的饮食。应大量喝水，冲刷尿道，促进细菌的排出。适当进行有氧运动，增强体质以提高免疫力。