再生障碍性贫血的治愈应根据患者的情况判断，不同的情况治愈率也有所不同。再生障碍性贫血根据起病时间主要分为急性再生障碍性贫血、慢性再生障碍性贫血。根据再生障碍性贫血的轻重，分为普通型再生障碍性贫血、重型再生障碍性贫血和极重型再生障碍性贫血。
对于普通型再生障碍性贫血，此类患者大多不需输血，口服中药或环孢素以及升血小板的药物，随着治疗时间的推移可能会达到治愈的情况，此时一般不会影响寿命。
而重型再生障碍性贫血和极重型的再生障碍性贫血，只有极少部分能通过药物治疗治愈，部分患者需进行异基因造血干细胞移植。
多数患者造血干细胞移植的治愈效果较好，移植成功率大概为70%，但要结合患者生病的时间长短以及自身的状态，例如是否有重症的感染、脏器功能的衰竭，像肾衰竭、心功能衰竭，或合并其他的相关疾病等。
部分患者可通过药物治愈，还可通过异基因造血干细胞移植获得治愈，但某些特别危重症的患者，成功的概率并不高，可能会失去进行造血干细胞移植的机会。
即使有情况较好的患者做了造血干细胞移植，也可能会由于某些并发症，比如排异、感染、植入不良等原因失败而导致的死亡。再生障碍性贫血虽不 是一种恶性疾病，但仍有一部分患者会因为各种原因死亡。