系统性红斑狼疮的诊断，主要依据临床表现和实验室检查，特别是自身抗体检查，确定原因后要进行相应治疗。
患者如果出现四肢关节疼痛、肿胀，皮肤常见有红斑，特别是面部蝶形红斑，就高度怀疑系统性红斑狼疮，此时需进行自身抗体检查、体液免疫功能、血常规、尿常规等检查，综合判断是否为系统性红斑狼疮。
如果是系统性红斑狼疮，其自身抗体特别是抗核抗体通常是阳性的。另外，像双链DNA抗体、SM抗体也是阳性的，同时补体降低。
血液系统提示白细胞降低、贫血、血小板减少，及尿常规提示有蛋白尿，还有红细胞增多等，这些高度提示是否患有系统性红斑狼疮，其中诊断标准一共有11条，达到4条以上，就能诊断系统性红斑狼疮。