乙肝病毒e抗原转阴，是乙肝病毒治愈的关键步骤。一旦感染乙肝病毒，首先出现表面抗原阳性，其次出现乙肝e抗原阳性，乙肝e抗原持续一段时间后会转阴，经过窗口期会出现乙肝e抗体。
因此乙肝e抗原转阴，预示着病人进入恢复期，较快会出现乙肝e抗体，出现乙肝e抗原的血清转换。经过3个月左右，乙肝表面抗原可能会逐渐消失，乙肝表面抗体出现，乙肝病毒彻底清除，特别是成年人新感染的乙肝病毒，90%以上会出现自然清除的过程。
慢性肝炎病人乙肝表面抗原阳性，通常提示为大三阳的病人，需要进行抗病毒治疗，抗病毒治疗目标是让HBV-DNA转阴。
如果HBV-DNA阴性，预示治疗有效，但不能停药，因为抗病毒药可抑制病毒但不能杀病毒。再进一步治疗，病人可从大三阳变成小三阳，出现乙肝e抗原转阴。
因此，乙肝e抗原转阴预示大三阳病人治疗有效，但是要动态观察是否出现血清转换，即乙肝表面e抗原转阴后乙肝e抗体是否会出现。
如果出现乙肝e抗体转阴，需要继续治疗，部分病人可能会达到最终的临床治疗目标，乙肝表面抗原转阴，乙肝表面抗体出现。随着乙肝表面抗原转阴，病人肝功能逐渐会恢复，病毒不复制，可能达到临床治愈目标。