奥美拉唑属于质子泵抑制剂，主要的功效是可以特异性地抑制胃壁细胞的氢钾ATP酶，这样就可以减少胃酸的分泌，减少基础胃酸的分泌，也可以减少在刺激状态下的胃酸分泌，所以属于消化系统疾病当中最常用的一类药物。
有消化性溃疡或者是急性胃黏膜病变，或者是有胃癌的时候，胃酸的大量分泌可以导致上腹痛或者是腹胀，甚至恶心、呕吐，通过应用质子泵抑制剂，比如奥美拉唑抑制ATP酶，可以减轻症状。
尤其对于上消化道出血的情况，比如有消化性溃疡出血、胃食管反流病、食管胃底静脉曲张破裂出血，这时候有效地降低肠道pH值，对疾病的恢复有好处。
但是也要避免长期大量服用，尤其是对老年人，如果长期服用会加重骨质疏松，甚至会增加呼吸道感染的概率。
另外，对于合并心脑血管基础疾病的患者，长期口服氯吡格雷时，建议选用其他类的质子泵抑制剂，奥美拉唑可能会减弱氯吡格雷的作用，使氯吡格雷达不到预期的抗血小板的效果。