奥美拉唑属于质子泵抑制剂，耐受性比较好，临床上常用于酸相关性疾病。但是大量、长期应用也会出现一些并发症，比如骨质疏松、胃黏膜萎缩、胃息肉、加重肺部感染等不良的后果。
另外，奥美拉唑本身有副作用，表现为腹痛、腹泻、恶心、腹胀、失眠等，所以在服用奥美拉唑时，一定在医生的指导下应用。
奥美拉唑的量和时间的把控必须根据不同的病情，进行不同的选择，比如对于反流性食管炎，用药的时间是4-8周，8周以后，部分病人仍然会出现胃食管反流的临床表现，此时可能需要延长用药的时间。
另外在用双抗治疗的时候，用质子泵抑制剂一般也不会超过6个月，因此对质子泵抑制剂的量和时间一定要在医生指导下应用。