慢性肠胃炎在临床上称为慢性胃肠炎，确诊慢性胃肠炎需要做的检查有消化道内镜、幽门螺杆菌检测、粪便检查、血液检查、影像学检查、病理检查等。
1、消化道内镜：主要有胃镜、肠镜，胃镜是食管、胃、十二指肠疾病最常用和最准确的检查方法。内镜检查不仅能直视黏膜病变，还能取活检，可以明确是否有消化性溃疡、胃癌等，有助于明确病因；
2、幽门螺杆菌检测：幽门螺杆菌是引起慢性胃肠炎最主要的原因，进行幽门螺杆菌检查，有助于明确是否是幽门螺杆菌感染引起的慢性胃肠炎；
3、粪便检查：粪便检查可以观察到大便形态等变化，明确是否由感染性因素引起了慢性胃肠炎；
4、血液检查：感染性胃肠炎患者的白细胞会有升高的现象，有助于辅助诊断；
5、影像学检查：常用的检查有超声、CT、MRI、X线等，可以明确是否有胃肠道的器质性病变，如溃疡、肿瘤等，引起了慢性的胃肠炎；
6、病理检查：在胃肠镜下取病理组织进行活检，有助于明确慢性胃肠炎具体的病变类型。
还可以进行肝功能检查等，患者应当积极配合医生的检查，并且在医生的指导下采取相应的治疗，以免延误病情。