慢性乙肝小三阳能否办健康证，要根据具体情况进行判断。如果情况较好就能办健康证，如果情况不好就不能办健康证。
1、情况较好：如果慢性乙肝小三阳患者经过检查后，肝功能和乙肝病毒定量正常，也不从事餐饮、医疗、美容等行业，此时就可以办健康证。无需过度担心，并不会有影响；
2、情况不好：如果慢性乙肝小三阳患者检查后发现肝功能存在异常表现，而且需要从事餐饮、医疗、美容等服务行业，此时就不能办健康证。
乙肝小三阳也就是乙肝表面抗原、乙肝e抗体、乙肝核心抗体三项阳性，提示机体病毒复制不活跃，但是仍然存在一定的传染性，主要传播途径是血液传播、性接触传播等。如果没有积极进行处理，还是可能会对肝功能造成损伤。若患有痢疾、伤寒、活动性肺结核等，就不能办健康证。