肾结石微创手术费用与术式有关，若为体外冲击波碎石术，费用约1500元。若为输尿管镜取石术、经皮肾镜取石术等，费用约20000元。
1、体外冲击波碎石术：该手术涉及的医疗设备主要有B超、碎石机等，术中确定好结石位置，利用碎石机产生的冲击波击碎结石，使粉末状态的结石随尿液排出，不损伤患者。由于术中不需要特殊的药物、医疗器械等，所以费用较低，在1500元左右。
2、输尿管镜取石术：该手术需要用到输尿管镜、碎石机、麻醉药等，将输尿管镜经尿道进入肾脏，探及结石位置后进行粉碎，利用套石网将粉碎的结石取出，手术费用在20000元左右。
3、经皮肾镜取石术：此项手术主要借助肾镜完成，在腰部置入肾镜，同样需要进行麻醉、碎石等步骤，费用也在20000元左右。
由于地域、医院等级等不同，手术费用存在差异性，建议患者到当地医院进行咨询。