结膜吸允线虫的预防可以从控制传染源、切断传播途径与保护易感人群入手。
1、控制传染源：感染结膜吸吮线虫的犬、猫等家畜是人体感染的主要传染源。为防止带虫动物传染人，应及时诊治动物结膜吸允线虫病。
2、切断传播途径：媒介果蝇为本虫的中间宿主。由果蝇舔吸带虫动物的眼部后，再舔吸其他动物或人眼而构成传播。加强对动物宿主的管理及防治、搞好环境卫生，尤其对腐败水果类垃圾的及时清理，消除果蝇的孳生地，减少果蝇的密度，对降低本病的发病有一定的作用。
3、保护易感染人群：注意环境卫生和个人眼部卫生，不在室外睡觉。主要治疗方法是取出虫体和对症治疗，虫体取出后，症状多能很快消失。适当使用消炎眼药水以预防和治疗继发感染。同时加强随访，防止复发。
参考资料：[1]卢致民，李凤铭.临床寄生虫学检验.第1版[M].武汉.华中科技大学出版社.2013.