线虫对人体的危害程度与线虫的种类、寄生虫数量(或称虫荷)发育阶段、寄生部位、虫体的机械和化学刺激，以及宿主的营养及免疫状态等因素有关。
1、幼虫所致损害：幼虫进入宿主体内并在宿主体内移行过程中可造成相应的组织或器官损害。
如钩虫的感染期幼虫侵入皮肤可致皮炎；蛔虫或钩虫的幼虫在移经肺部时，可引起肺部损害，甚至引起蛔虫性或钩虫性哮喘；旋毛虫幼虫寄生于肌肉内可导致肌炎和全身症状。
一些寄生于犬、猫等哺乳动物的线虫幼虫进入人体后，由于人体不是其适宜宿主，这些幼虫可引起皮肤或内脏幼虫移行症。
2、成虫所致损害：成虫在寄生部位因摄取营养、机械性损害和化学性刺激以及免疫病理反应等可导致宿主营养不良组织损伤、出血、炎症等病变。通常组织内寄生线虫对人体的危害远较肠道线虫严重。