躯体忧虑障碍是以持续存在躯体症状为特征的精神障碍。这些躯体症状给患者造成了痛苦，使患者过度关注，产生反复就医行为，并引起个人、家庭、社交、教育、职业及其他重要领域的功能损害。需与躯体疾病、疑病障碍等进行鉴别。
1、躯体疾病：原发性躯体疾病具有明确、与症状相称的客观检查结果，其症状主诉相对集中，并能用当今的医学知识解释。
2、疑病障碍：两者具有类似的发病机制，患者有着类似行为特征。
3、抑郁症抑郁症常伴有躯体不适症状，而躯体忧虑障碍也常伴有抑郁情绪。
4、焦虑障碍焦虑障碍的患者可能有对躯体疾病焦虑和躯体症状，此时的疾病焦虑是他们众多焦虑之一；惊恐障碍所伴有的躯体症状是常常与惊恐相伴。
5、分离性运动和感觉障碍：分离性运动和感觉障碍患者的躯体症状有心理致病的证据，表现在时间上与应激性事件及相关问题或乱有明确的联系，心理治疗，特别是暗示和催眠治疗有较好的疗效。
6、精神分裂症：某些精神分裂症患者可有躯体不适症状、疼痛症状等，但他们往往对躯体不适症状及疼痛症状漠不关心或对此予以荒谬离奇的解释，常有思维形式障碍或幻觉妄想 ；患者并不积极求治，借此可与躯体忧虑障碍鉴别。
7、物质依赖:患者常常滥用苯二氮草类药物甚至阿片类镇痛剂，形成依赖。当出现戒断症状时，疼痛非常常见，但这类患者的疼痛必须继续使用成瘾药物或用替代药物才能缓解，借此可与躯体疼痛障碍鉴别。