腰骶痛的病因复杂多样，脊柱外伤性疾病、脊柱炎症性疾病、脊柱退行性变等都可能引起腰骶痛。
1、脊柱外伤性疾病：因各种直接或者间接暴力、肌肉拉伤所致的腰椎骨折、脱位或者腰肌软组织损伤，比如腰椎骨折、腰间盘突出、腰肌劳损等。
2、脊柱炎症性疾病：可见于结核菌、化脓菌或者伤寒菌对腰部及软组织的侵犯形成感染性炎症，比如脊柱结核等。也见于无菌性炎症，比如腰骶神经炎、腰肌纤维组织炎、强直性脊柱炎等。
3、脊柱退行性变：一般认为人从20-25岁脊柱开始退变，包括纤维环及髓核组织退变。如过度活动、经常处于负重状态，则髓核易于脱出。前后纵韧带、小关节随椎体松动移位，引起韧带骨膜下出血，微血肿机化，骨化形成骨刺。髓核突出和骨刺可压迫或刺激神经引起疼痛。比如椎间盘突出、腰椎管狭窄等疾病。
4、先天性疾病：最常见于腰骶部，是引起腰骶痛的常见病因。常见的有隐性脊柱裂、腰椎骶化或骶椎腰化、椎管狭窄和椎体畸形等。
5、女性妇科疾病：盆腔炎、宫颈炎也会出现腰骶部的疼痛。